Η συγκομιδή της βανίλιας γίνεται από άνοιξη μέχρι και καλοκαίρι ανάλογα με την ποικιλία. Τα κριτήρια που λαμβάνονται υπόψιν για να ξεκινήσει η συγκομιδή είναι το μέγεθος των καρπών, η περιεκτικότητά τους σε σάκχαρα και το χρώμα της σάρκας και του φλοιού. Όσα φρούτα προορίζονται για να φαγωθούν νωπά μαζεύονται με το χέρι. Όσα προορίζονται για αποξήρανση μαζεύονται μηχανικά για να μειωθεί το κόστος των εργατικών.