Παρόλο που τα λιπάσματα αποτελούνται από συστατικά ωφέλιμα για τα φυτά η λανθασμένη και υπερβολική εφαρμογή μπορεί να δημιουργήσει προβλήματα στον κήπο αλλά και στο περιβάλλον. Πριν την χορήγηση λίπανσης ο κηπουρός πρέπει να συμβουλεύεται το γεωπόνο του. Οι παράγοντες που εξετάζει ο γεωπόνος είναι :
- το είδος του φυτού : φυτά που ανήκουν ακόμα και στην ίδια οικογένεια μπορεί να έχουν διαφορετικές απαιτήσεις
- την εποχή εφαρμογής : τα περισσότερα προγράμματα λίπανσης εφαρμόζονται πριν την έναρξη της βλαστητικής περιόδου του φυτού. Επίσης οι υψηλές θερμοκρασίες μπορεί να δημιουργήσουν ζημιές συνδυαζόμενες με λίπανση
- την περιεκτικότητα του εδάφους στο επιθυμητό στοιχείο και τη διαθεσιμότητα του στοιχείου αυτού : αυτή εκτιμάται μέσω εδαφολογικής ανάλυσης
- τον τύπο του λιπάσματος : ο κάθε τύπος λιπάσματος εφαρμόζεται διαφορετικά και ικανοποιεί διαφορετικές ανάγκες. Για παράδειγμα αν απαιτείται άμεση διόρθωση της θρεπτικής ανισορροπίας του φυτού εφαρμόζονται υγρά λιπάσματα.
- τον τόπο φύτευσης του φυτού : στις γλάστρες προτείνεται κυρίως η εφαρμογή υδατοδιαλυτών λιπασμάτων γιατί αφήνουν λιγότερα άλατα στο χώμα
Αντίστοιχα ο κηπουρός πρέπει να φροντίζει να χρησιμοποιεί τη συνιστώμενη ποσότητα, να διατηρεί το φυτό ποτισμένο, να αποφεύγει την επαφή του λιπάσματος με τα φύλλα ή τον βλαστό του φυτού (ιδιαίτερα στα κοκκώδη) και να φροντίζει η εφαρμογή να γίνεται σε σωστές καιρικές συνθήκες (χαμηλή θερμοκρασία και ηλιακή ακτινοβολία).